Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc3bQ6NWW9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms