Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HelbQ6NVF4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HelbQ6NVF4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms