Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms