Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nomo1Q6GQT9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nomo1Q6GQT9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms