Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Carmil1Q6EDY6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms