Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep290Q6A078 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Cep290Q6A078 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep290Q6A078 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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