Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg9aQ68FE2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg9aQ68FE2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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