Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp9cQ66X01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms