Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms