Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knl1Q66JQ7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms