Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VclQ64727 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VclQ64727 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VclQ64727 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VclQ64727 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VclQ64727 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms