Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Top2bQ64511 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Top2bQ64511 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms