Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ca4Q64444 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms