Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms