Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndrg1Q62433 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms