Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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