Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl12Q62401 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms