Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SypQ62277 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SypQ62277 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SypQ62277 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SypQ62277 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SypQ62277 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms