Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Kdm5dQ62240 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5dQ62240 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5dQ62240 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms