Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six3Q62233 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six3Q62233 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms