Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms