Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms