Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msi1Q61474 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms