Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PcolceQ61398 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcolceQ61398 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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