Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2bQ61313 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms