Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms