Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcp1Q61233 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms