Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf4bQ61136 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms