Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nab1Q61122 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nab1Q61122 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms