Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Scarb1Q61009 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scarb1Q61009 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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