Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms