Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P4ha1Q60715 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P4ha1Q60715 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms