Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd4Q60688 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd4Q60688 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms