Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms