Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms