Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms