Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms