Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thoc6Q5U4D9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thoc6Q5U4D9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms