Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brip1Q5SXJ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms