Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssh2Q5SW75 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssh2Q5SW75 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms