Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms