Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms