Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd40Q5SUE8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms