Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms