Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms