Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms