Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grhl3Q5FWH3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grhl3Q5FWH3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms