Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3558Q5FWC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms