Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms