Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8bQ5DU41 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8bQ5DU41 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms